生物標記探索 | 甲基化 DNA 的分析
生物標記探索
甲基化 DNA 的分析
■ 以 CORBA 方法對胚胎幹細胞、腦細胞、肝細胞中的 Nanog和Hnf4a基因進行 DNA 甲基化分析
細胞分裂後,基因功能持續變化,而DNA鹼基序列沒有變化,此現象稱為表觀遺傳學。越來越多證據顯示,表觀基因的異常與癌症及其他許多疾病有關。
甲基化 DNA 是一種表觀基因控制方式,可望為 ES 及 iPS 細胞篩選提供生物標記,應用於疾病診斷及再生醫學。
此處舉例說明 以 CORBA 方法對胚胎幹細胞 (ES cells)、腦細胞、肝細胞的 Nanog 和 Hnf4a 基因進行DNA 甲基化分析。使用 DNA/RNA 分析專用 MultiNA 微晶片電泳系統完成分析作業。
*CORBA: COmbined Bisulfite Restriction Analysis 組合亞硫酸氫鹽限制分析法

膠體影像呈現與電泳圖
TheNanog 基因對於維持胚胎幹細胞 (ES cells) 的多能性很重要,在胚胎幹細胞的甲基化表現較低,而在腦部的表現較高。參與肝臟特異性基因表現的 Hnf4a 基因,在肝臟的甲基化表現較低,而在腦部的表現較高。
* 數據由東京大學農業與生命科學研究所 Shiota 教授提供
DNA 甲基化分析可採用多種分析法進行,包括亞硫酸氫鹽定序。而其中 CORBA 法成本低、通量高,可有效篩選樣品進行定序。
Microchip Electrophoresis System for DNA/RNA

使用微晶片的電泳系統,依大小分離 DNA 和 RNA 樣品,因此可以確認核酸 (DNA/RNA) 樣品大小並大致定量。微晶片電泳系統可快速進行電泳分離,螢光檢測器則確保分析的高靈敏度,此外並可全自動完成作業。