實例:使用 DNA 擴增試劑,以電泳和血液直接 PCR 進行抗藥性基因 SNP 分型

藥物基因體學 (PGx) 是指依據遺傳資訊,預測藥物療效和副作用的研究。基因體序列中的單核苷酸多型性 (SNP),可望成為藥物基因體學的生物標記,目前已展開研究,探討藥物基因體學是否能夠有效預測藥物 (例如抗癌藥物) 的副作用,以及為個別患者開發量身打造的藥物。

以下舉例說明 SNP 分型。

ABCC11 基因屬於 ATP 結合匣運輸蛋白基因家族,存在於細胞膜上。這個基因已知具有抗藥性,作用是將物質從細胞內排出細胞外。
經由使用 Ampdirect Plus DNA 擴增試劑以血液直接進行 PCR,和 DNA/RNA 分析專用 MultiNA 微晶片電泳系統 ,這個基因的 SNP 評估結果如下所示。

SNP Typing of ABCC11 Gene Using MultiNA (Gel Image)

使用 MultiNA (Gel Image) 進行 ABCC11 基因 SNP 分型

這個方法與傳統的 PCR-RFLP 方法不同。 PCR-RFLP法是以 PCR 擴增目標DNA ,然後以限制酶消化進行序列特異性切開反應,再利用凝膠電泳分辨經限制酶消化後產生的DNA片段長度。這個方法僅需透過單個試管的單一 PCR 反應和電泳分析,即可完成 SNP 分型。這是便利且經濟的 SNP 分型方法,適用於多重樣品的分析。

Microchip Electrophoresis System for DNA/RNA

使用微晶片的電泳系統,依大小分離 DNA 和 RNA 樣品,因此可以確認核酸 (DNA/RNA) 樣品大小並大致定量。微晶片電泳系統可快速進行電泳分離,螢光檢測器則確保分析的高靈敏度,此外並可全自動完成作業。